بخشی از فعالیت‌های بنیاد پژوهشهای اسلامی به صورت تقاضا محور براساس نیازهای پژوهشی مؤسسات و نهادهای مختلف داخلی و خارجی شکل گرفته است. انعقاد تفاهم‌نامه‌ها و قراردادهای گوناگون برای انجام پژوهشهای کاربردی حاصل این سویه از فعالیت‌های بنیاد است. برخی از نهادهای ملی و بین‌المللی همکار عبارت است:
